Bảng A
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Yokohama F Marinos 6 5 0 1 9 15
2 Consadole Sapporo 6 3 1 2 3 10
3 Jubilo Iwata 6 2 0 4 -1 6
4 Sagan Tosu 6 1 1 4 -11 4
Bảng B
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Urawa Red Diamonds 6 1 5 0 1 8
2 Kawasaki Frontale 6 2 2 2 5 8
3 Shimizu S-Pulse 6 2 2 2 -7 8
4 Shonan Bellmare 6 1 3 2 1 6
Bảng C
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Nagoya Grampus Eight 6 5 0 1 6 15
2 Sanfrecce Hiroshima 6 3 0 3 5 9
3 Yokohama FC 6 2 0 4 -3 6
4 Vissel Kobe 6 2 0 4 -8 6
Bảng D
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Avispa Fukuoka 6 4 1 1 3 13
2 Kashima Antlers 6 3 1 2 2 10
3 Albirex Niigata 6 2 0 4 -2 6
4 Kashiwa Reysol 6 1 2 3 -3 5
Bảng E
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 FC Tokyo 6 3 1 2 4 10
2 Gamba Osaka 6 3 1 2 4 10
3 Kyoto Purple Sanga 6 3 0 3 -2 9
4 Cerezo Osaka 6 1 2 3 -6 5
Chú ý: Đội bóng có dấu màu đỏ đã được lọt vào vòng tiếp theo.